înregistrare Logare
Puncte:1
avatar Ubuntu

SRA Toolkit Eroare la folosirea prefetch

drapel cn
Bharat

Am instalat setul de instrumente SRA folosind aceste comenzi:

cd ~/Descărcări

wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/n/ncbi-vdb/libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
wget http://old-releases.ubuntu.com/ubuntu/pool/universe/s/sra-sdk/sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

sudo apt-get install ./libncbi-vdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb 
sudo apt-get install ./libncbi-wvdb2_2.9.3+dfsg-2_amd64.deb

pisica <<EOF | sudo tee /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs 
Pachetul: libncbi-vdb2 
Pin: versiunea 2.9.3+dfsg-2 
Prioritate PIN: 1337

Pachetul: libncbi-wvdb2 
Pin: versiunea 2.9.3+dfsg-2 
Prioritate PIN: 1337 
EOF

sudo apt-get install ./sra-toolkit_2.9.3+dfsg-1build2_amd64.deb

După instalare, am descărcat un fișier SRA și când am încercat să descarc un alt fișier SRA, mi-a dat următoarea eroare:

prefetch:` eroare de căutare a simbolului: /lib/x86_64-linux-gnu/libncbi-vdb.so.2: simbol nedefinit: vdb_mbedtls_md_setup

Cum pot rezolva asta?

97
0 + 0
Puncte:0
N0rbert avatar Ubuntu
drapel zw
N0rbert

Se pare că te urmărești raspunsul meu. A fost scris acum 1,5 an. Se poate schimba ceva.

Conform https://github.com/ncbi/sra-tools/issues/546 trebuie să eliminați această versiune a SRA instalată local până la

sudo rm /etc/apt/preferences.d/pin-sra-libs
sudo apt-get purge --autoremove libncbi-vdb2 libncbi-wvdb2 sra-toolkit

și instalează cea mai nouă versiune de la https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=software in schimb.

0 + 0
drapel romania
SEF 777
întrebarea această in alte limbi:

Postează un răspuns

Majoritatea oamenilor nu înțeleg că a pune multe întrebări deblochează învățarea și îmbunătățește legătura interpersonală. În studiile lui Alison, de exemplu, deși oamenii își puteau aminti cu exactitate câte întrebări au fost puse în conversațiile lor, ei nu au intuit legătura dintre întrebări și apreciere. În patru studii, în care participanții au fost implicați în conversații ei înșiși sau au citit transcrieri ale conversațiilor altora, oamenii au avut tendința să nu realizeze că întrebarea ar influența – sau ar fi influențat – nivelul de prietenie dintre conversatori.