Eroare libGL: nu s-au încărcat driverele iris și swrast în Ubuntu 20.04

Am câteva probleme (consultați mesajele de mai jos) cu lansarea de programe științifice terțe (de exemplu, coot, pymol sau himer).

Folosesc binarul coot (0.9.5). Chimera este 1.14 build 42018. Ubuntu 20.04.2 LTS Gnome. Folosesc pymol-open-source de la Github

Placă grafică: Controler compatibil VGA: Intel Corporation UHD Graphics 620 (Whiskey Lake)
Model: CPU Intel(R) Core(TM) i7-8565U la 1,80 GHz

Se pare că există unele probleme cu irisul și swrastul (vă rugăm să consultați mesajul de mai jos).

Primesc întotdeauna acest mesaj pentru himeră:

Eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a putut deschide iris: /usr/lib/dri/iris_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: Nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: iris
Eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a putut deschide iris: /usr/lib/dri/iris_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: Nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: iris
eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a deschis swrast: /usr/lib/dri/swrast_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: swrast
X Eroare la cererea eșuată: BadValue (parametru întreg în afara intervalului de funcționare)
  Cod operațional major al solicitării eșuate: 152 (GLX)
  Cod operațional minor al solicitării eșuate: 3 (X_GLXCreateContext)
  Valoarea cererii eșuate: 0x0
  Numărul de serie al cererii eșuate: 890
  Numărul de serie curent în fluxul de ieșire: 891

Am primit acest mesaj pentru pymol:

Qt nu este disponibil, folosind interfața GLUT/Tk
Eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a putut deschide iris: /usr/lib/dri/iris_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: Nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: iris
Eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a putut deschide iris: /usr/lib/dri/iris_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: Nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: iris
eroare libGL: MESA-LOADER: nu s-a deschis swrast: /usr/lib/dri/swrast_dri.so: nu se poate deschide fișierul obiect partajat: nu există un astfel de fișier sau director (căi de căutare /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri: \$${ORIGIN}/dri:/usr/lib/dri)
Eroare libGL: a eșuat încărcarea driverului: swrast
freeglut Nu se poate crea context OpenGL 1.0 (steaguri 0, profil 0)
X Eroare la cererea eșuată: BadValue (parametru întreg în afara intervalului de funcționare)
  Cod operațional major al solicitării eșuate: 152 (GLX)
  Cod operațional minor al solicitării eșuate: 24 (X_GLXCreateNewContext)
  Valoarea cererii eșuate: 0x0
  Numărul de serie al cererii eșuate: 50
  Numărul de serie curent în fluxul de ieșire: 51
 PyMOL: terminarea bruscă a programului.

Multumesc pentru ajutor.

lsmod | grep 
drm rm_kms_helper 184320 1 i915 
syscopyarea 16384 1 drm_kms_helper
sysfillrect 16384 1 drm_kms_helper 
sysimgblt 16384 1 drm_kms_helper 
fb_sys_fops 16384 1 drm_kms_helper 
drm 491520 9 drm_kms_helper,i915

$ glxinfo | grep Furnizor
Furnizor: Intel Open Source Technology Center (0x8086)

$ lshw -C video 
AVERTISMENT: ar trebui să rulați acest program ca super-utilizator. 
*-afişa 
descriere: controler compatibil VGA 
produs: UHD Graphics 620 (Whiskey Lake) 
furnizor: Intel Corporation 
ID fizic: 2 
info autobuz: pci@0000:00:02.0 
versiunea: 00 
lățime: 64 biți 
ceas: 33 MHz 
capabilități: vga_controller bus_master cap_list rom 
configurație: driver=i915 latență=0 
resurse: irq:150 memorie:9b000000-9bffffff memorie:50000000-5fffffff ioport:3000(dimensiune=64) 
memorie: c0000-dffff

$ vaninfo 
informații despre libva: versiunea VA-API 1.7.0 
Informații libva: Încerc să deschid /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri/iHD_drv_video.so 
Informații libva: S-a găsit funcția init __vaDriverInit_1_7 
info libva: va_openDriver() returnează 0 
vainfo: versiunea VA-API: 1.7 (libva 2.6.0) 
vainfo: Versiune driver: driver Intel iHD pentru Intel(R) Gen Graphics - 20.1.1 () 
vainfo: Profil și puncte de intrare acceptate
VAProfileMPEG2Simple : VAEntrypointVLD 
VAProfileMPEG2Main : VAEntrypointVLD 
VAProfileH264Main: VAEntrypointVLD 
VAProfileH264Main : VAEntrypointEncSliceLP 
VAProfileH264High : VAEntrypointVLD 
VAProfileH264High : VAEntrypointEncSliceLP 
VAProfileJPEGBaseline: VAEntrypointVLD 
VAProfileJPEGBaseline: VAEntrypointEncPicture
VAProfileH264ConstrainedBaseline: VAEntrypointVLD
VAProfileH264ConstrainedBaseline: VAEntrypointEncSliceLP
VAProfileVP8Version0_3 : VAEntrypointVLD 
VAProfileHEVCMain: VAEntrypointVLD 
VAProfileHEVCMain10 : VAEntrypointVLD 
VAProfileVP9Profile0 : VAEntrypointVLD 
VAProfileVP9Profile2 : VAEntrypointVLD

Tocmai am avut aceeași problemă cu Kiwix pe Linux Mint și am găsit întrebarea ta. Am reușit să-mi rezolv problema citind: https://github.com/kiwix/kiwix-desktop/issues/393. Problema pe care am înțeles-o este că driverul iris este configurat pe Ubuntu pentru a fi utilizat implicit pe laptopuri, în timp ce în cazul meu, pe vechea mea placă grafică a laptopului acceptă driverul mai vechi. Deci, soluția/soluția este să setați variabila de mediu înainte de a rula aplicația în promptul de comandă, astfel:

MESA_LOADER_DRIVER_OVERRIDE=i965 ./kiwix-deskop

Sper că te ajută și pe tine.

P.S. în cazul în care doriți să încercați să setați această variabilă permanent și nimic altceva nu se întrerupe, vedeți: Cum să setați permanent o variabilă de mediu

I ran into a similar problem when trying to run a python app in a virtual environment (anaconda3). It turned out that the library libstdc++.so used by the virtual env was different from the one used by the OS.

I needed first to find out the full paths to libraries involved:

DISPLAY=:0 LIBGL_DEBUG=verbose python test.py

This gave me a hint that the libstdc++.so.6 used here might be different from the one used by OS:

libGL: MESA-LOADER: failed to open /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri/i965_dri.so: /home/fairfax/anaconda3/envs/py3/bin/../lib/libstdc++.so.6
: version `CXXABI_1.3.8' not found (required by /usr/lib/x86_64-linux-gnu/dri/i965_dri.so)

Then I checked out the library used by the virtual env:

strings /home/fairfax/anaconda3/envs/py3/bin/../lib/libstdc++.so.6 | grep CXXABI

To find out that the flag CXXABI_1.3.8 was indeed missing. I was able to fix this by overwriting the virtual env version with the system version of libstdc++.so.6 and redirecting all symbolic links to the new version:

$~/anaconda3/envs/py3/lib$ ls -al | grep libstdc++     
 lrwxrwxrwx  1 fairfax fairfax       19 lis  1 08:55 libstdc++.so -> libstdc++.so.6.0.25                                                
lrwxrwxrwx  1 fairfax fairfax       19 lis  1 08:55 libstdc++.so.6 -> libstdc++.so.6.0.25                                              
-rw-r--r--  1 fairfax fairfax  1594864 říj 29 16:27 libstdc++.so.6.0.25

La nivel de pachet, acest lucru poate fi rezolvat prin instalare singur pachet:

sudo apt-get install libgl1-mesa-dri

Apoi despre pachete:

• Pymol este ambalat în Ubuntu cu versiunea 2.3.0, deci este instalabil de

  universul sudo add-apt-repository
  sudo apt-get install pymol
  

After many searches, I found a stack overflow post with more helpful answers for me at https://stackoverflow.com/questions/48453497/anaconda-libstdc-so-6-version-glibcxx-3-4-20-not-found

[Edit: OK, I solved my problem with the below steps, but now sometimes (not always!) when I run my python programs in this environment it gives the message free(): invalid pointer when my python program terminates, which is scary and undesirable. Though, it's a shorter error message so I'm keeping it for now :P]

Here's how I solved my problem:

1. I installed the latest version of gcc

conda install libgcc

After I tested it, it still didn't work for me, but maybe it will work for you.

2. I checked to see what kinds of linker files I had.

sudo find / -wholename "*conda*/**/libstdc++.so*"

Among other output files were the files (this environment is called moon)

/home/alex/miniconda3/envs/moon/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so.6
/home/alex/miniconda3/envs/moon/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so.6.0.26
/home/alex/miniconda3/envs/moon/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so.6
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so.6.0.26
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so.6.0.21

Before installing libgcc with conda, I only had the files

/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so.6
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so.6.0.28
/home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++.so

You are supposed to have exactly 3 files that look something like this in your directory - there was a duplicate created for some reason.

I decided to try getting rid of all of the files that were similar to the old ones with

rm /home/alex/miniconda3/envs/moon/lib/libstdc++*

And after this, my error message disappeared.